Osnovna podela bila bi po tipu vode:
- morski,
- slatkovodni
- boćati (brakični) akvarijum.
Temperaturni raspon deli akvarijume na:
- toplovodne
- hladnovodne.
Akvarijumi se također dele po vrsti organizama koje držimo, pa tako susrećemo biotopne ili zemljopisne akvarijume koji sadrže određene vrste organizama sa jednog biotopnog područja (npr. akvarijum područja Amazone sadrži biljke i ribe amazonskog sliva, a uslovi su određeni svojstvima kao i u prirodnom staništu).
A druga su vrsta društveni ili zajednički akvarijumi koji sadržavaju organizme bez obzira na njihovo prirodno poreklo i kojima su potrebni slični uslovi. Ovi su akvarijumi najpopularniji i najrašireniji među akvaristima.
Uz nabrojene „ukrasne“ postoje i specijalizirani akvarijumi: Karantinski akvarijum ima namenu lečenja i preventivne karantina kod unosa novih riba u akvarijum, a mrestni i uzgojni akvarijum služe za mrest, razmnožavanje i uzgoj mladih riba.
